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Detección de Erwinia chrysanthemi pv zeae (Sabet 1954) Victoria et al., 1975 en maíz en Morelos, México. Colegio de Postgraduados
Durán Peralta, Elisa.
La “pudrición del tallo del maíz” causada por Erwinia chrysanthemi pv zeae es una de las principales enfermedades del maíz (Zea mays L.) en los países tropicales y subtropicales. En el presente trabajo se realizó la extracción de ADN del patógeno y se realizó PCR utilizando los iniciadores ADE1 y ADE2, diseñados para E. chrysanthemi (Burkh.) Young et al. 1978, que amplifican un fragmento de 420pb del gen pelADE. Se demostró que estos también pueden ser utilizados para su detección por PCR en tiempo real con resultados similares a los citados en la literatura; sin embargo no pueden ser empleados para la cuantificación de la bacteria debido a la formación de estructuras secundarias. Mediante la caracterización fisiológica, bioquímica y análisis...
Palavras-chave: Zea mays L.; Erwinia chrysanthemi pv zeae; Pudrición del tallo del maíz; PCR en tiempo real; Gen pe/ADE; Corn stalk rot; Real time PCR; Gene Pe/ADE; Fitopatología; Maestría.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/555
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Detección de Erwinia chrysanthemi pv zeae (Sabet 1954) Victoria et al., 1975 en maíz en Morelos, México. Colegio de Postgraduados
Durán Peralta, Elisa.
La “pudrición del tallo del maíz” causada por Erwinia chrysanthemi pv zeae es una de las principales enfermedades del maíz (Zea mays L.) en los países tropicales y subtropicales. En el presente trabajo se realizó la extracción de ADN del patógeno y se realizó PCR utilizando los iniciadores ADE1 y ADE2, diseñados para E. chrysanthemi (Burkh.) Young et al. 1978, que amplifican un fragmento de 420pb del gen pelADE. Se demostró que estos también pueden ser utilizados para su detección por PCR en tiempo real con resultados similares a los citados en la literatura; sin embargo no pueden ser empleados para la cuantificación de la bacteria debido a la formación de estructuras secundarias. Mediante la caracterización fisiológica, bioquímica y análisis...
Palavras-chave: Zea mays L.; Erwinia chrysanthemi pv zeae; Pudrición del tallo del maíz; PCR en tiempo real; Gen pe/ADE; Corn stalk rot; Real time PCR; Gene Pe/ADE; Fitopatología; Maestría.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/555
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Detección de Trypanosoma cruzi en tejido y sangre murina por PCR convencional y en tiempo real ABCL
Davies,Carolina; Poma,Ramiro Hugo; Marino Cardozo,Rubén; Mora,María Celia; Ramos,Federico; Rajal,Verónica Beatriz; Basombrío,Miguel Ángel.
El objetivo del presente trabajo fue comparar la detección de ADN de Trypanosoma cruzi mediante PCR en tiempo real (qPCR) y PCR convencional en sangre periférica (n=25) y músculo esquelético (n=20) de ratones tratados con drogas tripanomicidas luego de 6 meses post-tratamiento. En las muestras de sangre se detectaron un total de 7 positivas por qPCR, mientras que por PCR convencional sólo se detectaron 2. En músculo esquelético, 15 muestras fueron positivas por qPCR y 3 por PCR convencional. Los resultados obtenidos demuestran que la fuerza de concordancia es débil entre las técnicas de PCR utilizadas para la detección de ADN de T. cruzi (k=0,37; 49% positivas por qPCR vs. 11% por PCR convencional, p=0,0001). En las muestras de sangre, los valores...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: PCR convencional; PCR en tiempo real; Ratones; Carga parasitaria; Sangre periférica; Músculo esquelético; Trypanosoma cruzi.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-29572014000400004
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Detección molecular de virus en cultivos de uchuva (Physalis peruviana) del suroeste de Antioquia (Colombia) Acta Agron. (Palmira)
Corrales-Cabra,Eríka; Higuita,Mónica; Restrepo,Andrea; Gallo,Yuliana; Gutiérrez,Pablo; Marín,Mauricio.
Resumen La uchuva es una de las frutas promisorias para la zona andina de Colombia gracias a su alta demanda internacional. En Antioquia, su siembra se concentra en el oriente, aunque otras subregiones como el norte y suroeste presentan condiciones óptimas para su cultivo. Ya que las enfermedades de origen viral son uno de los problemas emergentes de este frutal, en este estudio se evaluó la infección de virus de RNA que infectan los cultivos de uchuva en el suroeste de Antioquia. Para esto se utilizaron pruebas de RT-qPCR en muestras foliares de plantas sintomáticas y asintomáticas obtenidas en ocho lotes, así como en ocho muestras de semillas extraídas de frutos comercializados en esta subregión. Los resultados indicaron la presencia en al menos una...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Certificación de semilla; Fitopatología; PCR en tiempo real; Solanaceae; Virus de plantas.
Ano: 2022 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122022000100088
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DETECCIÓN Y CUANTIFICACIÓN DE Spongospora subterranea f. sp. subterranea EN PLANTAS SEÑUELO Y CULTIVOS DE PAPA EN COLOMBIA MEDIANTE qPCR Acta biol.Colomb.
GARCÍA BASTIDAS,NEVAR; GONZALO MORALES,JUAN; GONZÁLEZ JAIMES,PAOLA; GUTIÉRREZ,PABLO ANDRÉS; MARÍN MONTOYA,MAURICIO.
La sarna polvosa de la papa (Solanum tuberosum, S. phureja) causada por Spongospora f. sp. subterranea (Sss), es una de las enfermedades más limitantes de este cultivo. En Colombia, se han empleado diferentes métodos de detección asintomática de Sss, incluyendo bioensayos con plantas señuelo, PCR de ITS y pruebas de ELISA. Sin embargo, sus niveles de sensibilidad son bajos o requieren tiempos extensos. Una alternativa para complementar dichas herramientas es la PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR). En este trabajo se evaluó dicha técnica utilizando los juegos de cebadores SsTQF1-SsTQR1; Spon421F-Spon494R y SscolF-SscolR (diseñados en este estudio), bajo la metodología de SYBR Green®; mientras que con Taqman® se evaluaron los cebadores SponFSponR y la...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: PCR en tiempo real; Sarna polvosa; Solanum phureja; Solanum tuberosum.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2013000100009
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Determinación temprana del sexo fetal en plasma materno mediante PCR en tiempo real ABCL
Quintana,Silvina; Di Gerónimo,Vanesa; Estévez,María Susana; Passucci,Juan; Rivero,Mariana.
El análisis de ADN fetal libre en plasma materno permite estudiar material genético del feto sin realizar procedimientos invasivos sobre el embarazo. La identificación del sexo fetal mediante la detección de ADN del cromosoma masculino Y, en el plasma de mujeres embarazadas, es de gran utilidad en embarazos con riesgo para hiperplasia suprarrenal congénita o para enfermedades ligadas al cromosoma X. El presente estudio tuvo como objetivo evaluar la factibilidad y desempeño diagnóstico de la determinación del sexo fetal a través del análisis por PCR en tiempo real de ADN fetal libre en plasma de embarazadas. Se extrajeron 10 mL de sangre periférica a 134 pacientes embarazadas entre las semanas 5 y 32 de gestación, se separó el plasma y se efectuó extracción...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Determinación temprana del sexo fetal; PCR en tiempo real; Plasma materno.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-29572015000200007
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Expresión de los genes SS y CAS en chile CM-334 inoculado con Nacobbus Aberrans y con Meloidogyne incognita. Colegio de Postgraduados
García Espinoza, Jesús Antonio.
Los esteroles son compuestos que los nematodos fitopatógenos son incapaces de sintetizar y que deben obtenerlos de su hospedante. Los genes SS y CAS codifican las enzimas escualeno sintasa y cicloartenol sintasa, respectivamente, que son clave en la síntesis de esteroles en chile. Este trabajo tuvo por objetivos, comparar la expresión de ambos genes mediante PCR en tiempo real, en la interacción compatible CM-334-Nacobbus aberrans y en la incompatible CM-334-Meloidogyne incognita, a los 2, 7, 14, 21 y 28 días después de la inoculación (ddi), así como cuantificar el número de nematodos por raíz a los 2, 7, 14, 21, 28, 35 y 42 ddi. N. aberrans completó su ciclo de vida a los 42 ddi e indujo la sobreexpresión de SS y CAS hasta dos veces más que el testigo; su...
Palavras-chave: Capsicum annuum; Cicloartenol sintasa; Escualeno sintasa; Nematodos agalladores; PCR en tiempo real; Cycloartenol synthase; Real-time PCR; Root-knot nematodes; Squalene synthase; Maestría; Fitopatología.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/492
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Expresión de los genes SS y CAS en chile CM-334 inoculado con Nacobbus Aberrans y con Meloidogyne incognita. Colegio de Postgraduados
García Espinoza, Jesús Antonio.
Los esteroles son compuestos que los nematodos fitopatógenos son incapaces de sintetizar y que deben obtenerlos de su hospedante. Los genes SS y CAS codifican las enzimas escualeno sintasa y cicloartenol sintasa, respectivamente, que son clave en la síntesis de esteroles en chile. Este trabajo tuvo por objetivos, comparar la expresión de ambos genes mediante PCR en tiempo real, en la interacción compatible CM-334-Nacobbus aberrans y en la incompatible CM-334-Meloidogyne incognita, a los 2, 7, 14, 21 y 28 días después de la inoculación (ddi), así como cuantificar el número de nematodos por raíz a los 2, 7, 14, 21, 28, 35 y 42 ddi. N. aberrans completó su ciclo de vida a los 42 ddi e indujo la sobreexpresión de SS y CAS hasta dos veces más que el testigo; su...
Palavras-chave: Capsicum annuum; Cicloartenol sintasa; Escualeno sintasa; Nematodos agalladores; PCR en tiempo real; Cycloartenol synthase; Real-time PCR; Root-knot nematodes; Squalene synthase; Maestría; Fitopatología.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/492
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Importancia de las arvenses en la dispersión del amarillamiento letal del cocotero. Colegio de Postgraduados
Terán Villanueva, Nelba.
El cocotero (Cocos nucifera) uno de los cultivos tropicales de mayor importancia económica por su contribución sustancial a la seguridad alimentaria, se ha visto afectado por la enfermedad conocida como amarillamiento letal del cocotero (ALC), una de las más devastadores y que se ha localizado en todas las regiones productoras de México. El objetivo de la presente investigación fue analizar el papel que juegan las arvenses en la dispersión del ALC; para ello se realizó un registro de la flora asociada a la plantación, identificándose taxonómicamente las especies de plantas (arvenses); se hicieron análisis moleculares para detectar la presencia del fitoplasma de dicha enfermedad en las arvenses en ocho sitios dentro de la plantación. Posteriormente se...
Palavras-chave: Fitoplasma; PCR en tiempo real; Flora asociada; ALC; Myndus crudus; Phytoplasma; Real-time PCR; Associated flora; Producción Agroalimentaria en el Trópico; Maestría.
Ano: 2014 URL: http://hdl.handle.net/10521/2381
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Sobreexpresión de genes en la interacción de Spongospora subterranea (Wallr.) Lagerh. y dos cultivares de Solanum phureja Juz. et. Buk Rev. Protección Veg.
Rodríguez Fuerte,Verónica; Marín Montoya,Mauricio; Morales Osorio,Juan Gonzalo; Cotes Torres,José Miguel; Gutiérrez Sánchez,Pablo Andrés.
Con el fin de contribuir a un mejor conocimiento de los mecanismos que rigen la interacción entre Solanum phureja Juz. et. Buk. y Spongospora subterranea (Wallr.) Lagerh, agente causal de la sarna polvosa de la papa, se realizó en esta investigación el análisis del transcriptoma de dos cultivares: Criolla Colombia (susceptible) y Criolla Latina (tolerante), mediante pirosecuenciación 454. Los resultados indicaron diferencias entre los genes sobreexpresados en cada cultivar ante la infección con el patógeno. En el cultivar susceptible, la respuesta ocurre a partir de la activación transcripcional de genes asociados a la integridad de la pared celular, transducción de señales y genes involucrados en la respuesta a diferentes tipos de estrés. Los genes que...
Tipo: Journal article Palavras-chave: NGS; PCR en tiempo real; Sarna polvosa; Transcriptoma.
Ano: 2014 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522014000100003
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